OBIND
| OBIND: Oncological therapies through Biological Interaction Network Discovery |
El objetivo del proyecto OBIND es crear un sistema informatizado en el campo oncológico que posibilite la agregación y el análisis de conjuntos de datos heterogéneos, centrándose en el estudio de las interacciones entre diversas moléculas biológicas que quedan alteradas en las patologías tumorales a fin de producir un diseño racional en la planificación de nuevas terapias.
EL PROYECTO DE INVESTIGACIóN Y DESARROLLO
El estudio de patologías complejas, como las tumorales, requiere un enfoque de análisis de datos integrado. Además del análisis de los genes implicados en el proceso de transformación de las células normales en células tumorales (se han identificado más de 500), el estudio de la aparición de un tumor precisa también del análisis de las interacciones entre proteínas, ARN y moléculas pequeñas.
La planificación farmacéutica de nuevas terapias antitumorales especializadas y personalizadas es un proceso muy complejo; de hecho, el desarrollo de nuevas entidades químicas (NCE) requiere de media unos 13 años con costes cercanos a los mil millones de euros. El estudio del comportamiento de toda la red de interacciones moleculares permite predecir los efectos de una terapia en una escala más amplia que la de una interacción individual. Un requisito para dicho análisis es la consulta de bases de datos especializadas, disponibles en la red o en los centros de investigación.
Los problemas vinculados al análisis de los datos necesarios para el estudio de los tumores y el desarrollo de nuevos fármacos son la presencia de grandes cantidades de datos biomédicos de difícil consulta y manipulación, la fragmentación que no permite tener una visión de conjunto de las problemáticas ligadas a la patología investigada y la escasa interoperabilidad provocada por la variedad de formatos o la falta de estructuración.
El proyecto de investigación y desarrollo se propone optimizar:
- la selección de datos útiles para el estudio de las patologías tumorales de interés a través de un motor de búsqueda semántica conectado con las principales bases de datos de proteómica, transcriptómica, interactómica, quimiogenómica, biología estructural y química medicinal;
- el análisis integrado de distintos tipos de datos a fin de identificar las interacciones biológicas entre moléculas pequeñas, ARN y proteínas que influyen, o podrían influir, en la aparición, la evolución y la regresión de la patología tumoral;
- la aplicación de nuevos enfoques estadísticos y computacionales que intervienen en el procesamiento de datos y de modelos de análisis integrado de más fuentes de datos;
- la extrapolación de información estructural de moléculas protegidas por patentes (moléculas de andamiaje) que puedan incluirse en el proceso de planificación de nuevas terapias.
PO FESR Sicilia 2014/2020 – Acción 1.1.5 - PROYECTO N. 086202000366
COLABORADORES
- Exprivia S.p.A. – capofila
- Università degli Studi di Palermo
- Fundación Ri.MED
- Securproject
- OS2
- 2038 Innovation Company
- IRIB-CNR
